Taman Tengah, atau Naka Shin'en, merupakan salah satu taman asli yang dibuka untuk umum bersama dengan kuil pada tahun 1895. Taman ini ditata oleh Ogawa Jihei VII, seorang ahli pertamanan pada era Meiji (1868–1912), yang dikenal karena kepiawaiannya dalam menggunakan batu dan air. Ini adalah taman kolam, sedikit lebih besar dan lebih terbuka dibandingkan Taman Barat (Nishi Shin'en), yang juga ia rancang saat pembukaan kuil tersebut.

Taman Tengah terinspirasi oleh periode Muromachi (1336–1573). Pada masa ini, Buddhisme Zen berkembang pesat dan memberikan pengaruh yang besar terhadap perkembangan drama Noh, upacara minum teh, seni penataan taman, dan seni merangkai bunga.

Tamannya terasa sejuk dan terbuka, serta terdapat sebuah pondok di sepanjang jalan setapak yang menyajikan teh. Taman ini mewujudkan estetika wabi-sabi, keindahan bersahaja yang ditemukan dalam ketidaksempurnaan dan kefanaan, yang dihargai dalam upacara minum teh dan seni tradisional lainnya.

Batu-batu pijakan melintasi kolam dan merupakan ciri khas yang menarik di taman serta memungkinkan pengunjung melihat pemandangan dari air dan dari berbagai sudut. Batu-batu itu memiliki tinggi, bentuk, dan ukuran yang berbeda, serta membentuk jalur berliku yang menarik.

Kolam, Soryu Pond, memiliki nama yang sama dengan menara di sisi timur halaman kuil, Menara Soryuro. Keduanya dinamai berdasarkan Naga Biru dari Timur, salah satu pelindung langit dalam geomansi China kuno.

Bunga-bunga di taman ini antara lain azalea, bunga teratai, renda emas (ominaeshi; Patrinia scabiosifolia), dan iris telinga kelinci (kakitsubata; Iris laevigata).