El Jardín Central, o Naka Shin’en, es uno de los jardines originales que se abrieron al público junto con el santuario en 1895. Fue diseñado por Ogawa Jihei VII, maestro jardinero de la era Meiji (1868-1912), célebre por su magistral tratamiento de las rocas y el agua. Es un jardín con estanque, algo más amplio y abierto que el Jardín Oeste (Nishi Shin’en), diseñado también por él para la inauguración del santuario.

El Jardín Central se inspira en el periodo Muromachi (1336-1573), periodo en el que el budismo zen floreció e influyó profundamente en el desarrollo del teatro Noh, la ceremonia del té, la jardinería paisajística y el arreglo floral.

Es un jardín diáfano y abierto, y con un pabellón junto al sendero donde se sirve té. El jardín encarna la estética del wabi-sabi, la belleza sencilla que reside en la imperfección y la fugacidad, muy apreciada en la ceremonia del té y otras artes tradicionales.

Las piedras dispuestas para atravesar el estanque constituyen un interesante elemento del jardín que permite disfrutar de diferentes perspectivas, tanto desde el agua como desde distintos ángulos. Estas piedras varían en altura, forma y tamaño, y trazan un divertido y serpenteante sendero.

El estanque Soryu comparte su nombre con la torre situada en el lado este del patio del santuario, la torre Soryuro. Ambos reciben su nombre del dragón azul del este, uno de los guardianes celestiales de la antigua geomancia china.

Entre las flores del jardín destacan las azaleas, nenúfares, nardos sirios (ominaeshi o Patrinia scabiosifolia) y lirios de agua (kakitsubata o Iris laevigata).